Eur J Endocrinol：石蜡发现地转录组分析在肾上腺皮质癌诊断和预后中的价值

背景：肾上腺肿瘤(ACC)是一种稀有的内分泌肿瘤(每年每百万；还有有1-2例)，总体病状较差。诊断对病患者行政至关重要，但由于这种疾病的稀有，诊断很困难。事实上，在肾上腺(ACT)里面，ACC是稀有的，大多数是肾上腺腺瘤(ACA)。临床恶性分数称为Weiss分数，最常运用于诊断。然而，具有里面等分数和稀有第一组织学变异的不容易被形态学。特别是，确认由大巨噬细胞和马氏醛性颗粒第一组合而成的马氏醛性变异体的恶性是具有挑战性的。

ACC的5年总体生存率一般小于40%，但异质性。病状分层对聘请治疗决策很重要，特别是在辅助治疗。临床上常用的正要病状主因是再行Ki-67诱导指数。其他病状主因一般而言除此以外皮质醇分泌和年龄。

以当年的基因第一组科学研究表明，基因第一组变化集里面在完以外相同的分子可亚型。RNA第一组著者是分子可形态学的基石。RNA第一组著者将肾上腺腺瘤与肿瘤一区分出去，并深入科学研究出两第一组与病状密切相关的ACC：“C1a”亚第一组，其诱导基因过度传达，病状不良；“C1B”亚第一组，具有免疫特点，病状良好。从RNA第一组特点，已揭示特定的mRNA标记，如BUB1BPINK1的差异基因传达。这些靶向标记物加强了ACC的诊断和病状评估。然而，到目当年为止，RNA第一组著者及其靶向替代标记物仅限于除此以外的RNA，需要除此以外的冰冻第一组织样品。在常规实践里面，获取这种类型的材料要求很高，而对于ACC病患者来说，往往没有实现。

最近的3’RNA高通量关键技术捕获并高通量了多磷醛化RNA 3’端的短录像，这些录像不太容易被RNA降解。与基因传达微阵列或标准的以外长RNA高通量完以外相同，这种关键技术只需要少量和低质量的RNA，与福尔马林互换石蜡包埋(FFPE)样品兼容。

借此：正要借此是利用新的3’端RNA高通量关键技术，确认福尔马林互换石蜡包埋(FFPE)样品的RNA第一组著者。第二个借此是通过重点项目科学研究稀有的马氏醛巨噬细胞ACT变体，简介这种关键技术探险大型FFPE存档的能力。

原理：我们划入131例ACT：来自科钦该医院的培训链表和来自维尔茨堡该医院的独立测试链表。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE样品里面产生3’RNA第一组。

结果：在培训链表里面，无以外权负责聚类识别出3第一组：“C1A”型来袭性肿瘤(N=28，29%)、“C1B”型肿瘤(N=28，29%)和“C2”型腺瘤(N=39，41%)。FFPERNA第一组的病状价绝对值在测试链表里面给予证实(5年OS：C1a第一组为26%(N=26)，C1B第一组为100%(N=10)，p=0.003)。在除此以外再行和Ki-67的多变量模型里面，FFPERNA第一组是一个独立的病状主因(OS-HR 7.5，p=0.01)。马氏醛性淋巴巨噬细胞ACT(N=19)未形成任何特异簇。马氏醛巨噬细胞肿瘤(N=6)和恶性潜能未明的马氏醛性巨噬细胞肿瘤(N=4)均为“C1B”。

三幅1.培训链表里面ACT的FFPERNA第一组形态学A.基于2000个最易变的基因对ACT的非以外权负责形态学确认了三个正要第一组，对应于“C1A”来袭性肿瘤、“C1B”惰性肿瘤和“C2”腺瘤。B.运用于生成非以外权负责形态学的3个非负线性分解(NMF)标准的热三幅。激素(肾上腺分化)、诱导和免疫病症在每种ACT里面的传达。D.三第一组RNA第一组里面差异最显著的当年50个基因的传达谱。即通过迭代聚类正则表达式声称样品之间的相似度的完整性线性。行和列是病患者样品。实质线性绝对值的范围从0(绝不会闲聊)到1(始终闲聊)。

三幅2.完以外相同周围的FFPERNA第一组形态学。对培训链表里面5名病患者的两个完以外相同周围进行吉里精/伊红/比赛弗兰切片(放大40倍)，其里面一个为来袭性(-a)一区，一个为非来袭性(-b)一区。黑条代表50微米。白色交叉声称生物合成。白色交叉声称不典型的生物合成。B.所述为5名病患者量化的两个完以外相同的周围，其里面一个是来袭性(-a)，另一个是来袭性(-b)。不限于：Fuhrman核级不限于于马氏醛性巨噬细胞。C.基于PCA的两个正成分(Dim1、Dim2)的样品投影基于培训链表的95个独特病患者里面的2000个最可控基因。来自培训链表的样品显示为RNA第一组以外校学生着色的单纯方格。来自两个完以外相同周围的8名病患者的样品按病患者的颜色显示为以外三角形。

三幅3.ACC测试链表里面的FFPERNA第一组形态学和病状A.样品投影基于PCA的两个正成分(Dim1，Dim2)，基于培训链表里面95个独特病患者里面最可控的2000个基因。来自培训链表的样品显示为RNA第一组以外校学生着色的单纯方格。来自测试链表的样品以RNA第一组类别着色的基本三角形声称。B.根据测试链表里面I-III期ACC病患者的假设RNA第一组类型进行无病生存。根据测试链表的I-IV期ACC病患者的假设RNA第一组形态学，总的存活率。

论断：3’RNA高通量规是从FFPE样品里面确认ACT分子可类型的一种简易原理。这项关键技术应该有助于常规常用和大型回顾科学研究。

注解来历：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01