Eur J Endocrinol：石蜡标本转录组分析在肾上腺皮质腺癌诊断和预后中的价值

背景：肾上腺皮质腺癌(ACC)是一种有名的内分泌腺癌(每年每百万人里有1-2唯)，总体病状极低。病因对高血压经营管理至关重要，但由于这种疾病的有名，病因很麻烦。事实上，在肾上腺皮质(ACT)里，ACC是有名的，大多数是肾上腺皮质腺瘤(ACA)。病理学恶性满分叫做Weiss满分，最常主要用途病因。然而，很强里等满分和有名两组织学突变的不难以被类群。特别是，确定由大细胞内和精溶解颗粒两组成的精溶解突变体的恶性是很强挑战性的。

ACC的5年总体生存率一般低于40%，但异质性。病状分层对指导外科手术各项政策很重要，特别是在辅助外科手术。临床上常用的主要病状因素是分期Ki-67增殖指数。其他病状因素通常有数皮质醇分泌和年龄。

以前的性状两组数据分析表明，性状两组变化集里在并不相同的分子可亚型号。特异性两组记事是分子可类群的坚实。特异性两组记事将肾上腺皮质腺瘤与腺癌对应显现出来，并比对出有两两组与病状密切相关的ACC：“C1a”亚两组，其增殖性状过度隐含，病状不良；“C1B”亚两组，很强自体基本特征，病状较佳。从特异性两组基本特征，已推断出有特定的mRNA标记，如BUB1BPINK1的差异特异性。这些靶向标记物改善了ACC的病因和病状审计。然而，到目前为止，特异性两组记事及其靶向替代标记物仅限于极好的RNA，必需极好的冰冻两组织比对。在原则上实践里，获取这种多种类型号的材料要求很高，而对于ACC高血压来说，多半无具体方法实现。

在在的3’RNA脱氧核糖核乙酸技术开发捕获并脱氧核糖核乙酸了多酪氨乙酸化RNA 3’端的短片段，这些片段不太难以被RNA降解。与特异性微阵列或标准的全部都是长RNA脱氧核糖核乙酸并不相同，这种技术开发只必需少量和低质量的RNA，与福尔马林一般来说石蜡包埋(FFPE)比对兼容。

意在：主要意在是能用最初3’端RNA脱氧核糖核乙酸技术开发，确定福尔马林一般来说石蜡包埋(FFPE)比对的特异性两组记事。第二个意在是通过信息化数据分析有名的精乙酸细胞内ACT变体，展示这种技术开发探索大型号FFPE资料库的意志力。

方具体方法：我们纳入131唯ACT：来自科钦医院的体能训练缓冲区外和来自维尔茨堡医院的分立检验缓冲区外。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE比对里产生3’特异性两组。

结果：在体能训练缓冲区外里，无监督聚类识别出有3两组：“C1A”型号侵扰性腺癌(N=28，29%)、“C1B”型号腺癌(N=28，29%)和“C2”型号腺瘤(N=39，41%)。FFPE特异性两组的病状意义在检验缓冲区外里得到证实(5年OS：C1a两组为26%(N=26)，C1B两组为100%(N=10)，p=0.003)。在有数分期和Ki-67的多变量三维号里，FFPE特异性两组是一个分立的病状因素(OS-HR 7.5，p=0.01)。精溶解粒细胞内ACT(N=19)未能形成任何特异簇。精乙酸细胞内腺癌(N=6)和恶性潜能未能明的精溶解细胞内腺癌(N=4)均为“C1B”。

图1.体能训练缓冲区外里ACT的FFPE特异性两组类群A.基于2000个最易变的性状对ACT的非监督类群确定了三个主要两组，对应于“C1A”侵扰性腺癌、“C1B”惰性腺癌和“C2”腺瘤。B.主要用途生成非监督类群的3个非负矩阵分解(NMF)等级的热图。激素(肾上腺其发展)、增殖和自体征象在每种ACT里的隐含。D.三两组特异性两组里差异最相当大的前50个性状的隐含谱。即通过迭代聚类算具体方法表示比对之间的相似度的一致性矩阵。行和列是高血压比对。共识矩阵值的范围从0(从不聚在一起)到1(始终聚在一起)。

图2.并不相同地区外的FFPE特异性两组类群。对体能训练缓冲区外里5名高血压的两个并不相同地区外顺利进行锡林郭勒盟精/伊红/赛弗兰染色(放大40倍)，其里一个为侵扰性(-a)区外，一个为非侵扰性(-b)区外。黑条代表50微米。黑色上标表示有丝分裂。白色上标表示不典型号的有丝分裂。B.详细描述为5名高血压调制的两个并不相同的地区外，其里一个是侵扰性(-a)，另一个是侵扰性(-b)。不仅限于：Fuhrman核级疲倦主要用途精溶解细胞内。C.基于PCA的两个主组分(Dim1、Dim2)的比对投影基于体能训练缓冲区外的95个与众不同高血压里的2000个最可变性状。来自体能训练缓冲区外的比对显示为特异性两组高年级渐变的模糊三角形。来自两个并不相同地区外的8名高血压的比对按高血压的颜色显示为全部都是三角形。

图3.ACC检验缓冲区外里的FFPE特异性两组类群和病状A.比对投影基于PCA的两个主组分(Dim1，Dim2)，基于体能训练缓冲区外里95个与众不同高血压里最可变的2000个性状。来自体能训练缓冲区外的比对显示为特异性两组高年级渐变的模糊三角形。来自检验缓冲区外的比对以特异性两组一般来说渐变的完整三角形表示。B.根据检验缓冲区外里I-III期ACC高血压的预测特异性两组多种类型号顺利进行无病生存。根据检验缓冲区外的I-IV期ACC高血压的预测特异性两组类群，总的存活率。

结论：3’RNA脱氧核糖核乙酸具体方法是从FFPE比对里确定ACT分子可多种类型号的一种简便方具体方法。这项技术开发应该更难以原则上常用和大型号回顾数据分析。

原文出有处：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01